合村并居工程的开展，需要依照这5个具体流程进行，才能确保相关村民的合法权益不受侵害。
首先，相关部门需要结合上一级的国土空间规划，来制定乡村规划，村民对规划有意见，可以表达，相关部门对于合理意见，应当采纳。规划一旦批准，应当进行公布。规划先行这个步骤很重要，是整个合村并居工作的前提。
第二，进行民意调研，充分和村民沟通，大家是否愿意合并，是否愿意搬迁，可以充分表达自己的意见。同时，具体的实施方案须经过有权部门批准，这个过程也必须保障村民的听证权，只有让大家参与进来，发表意见，之后的补偿安置工作自然就能顺利进行。
第三，依据规划方案选取安置地址，建设安置住宅，先建后拆。京坤律师提醒，虽然合村并居不同于常规的土地征收，但是先补偿后搬迁的法定原则依旧适用，村民腾退房屋之前，必须能搬进盖好的安置楼内。
第四，依法合理补偿，完成腾房搬迁。只要和村民充分沟通协商，同时依法给予合理安置补偿，腾房工作将会得到广泛支持。
第五，处理后续的宅基地问题，提高土地使用效率，让村民从中受益，保障村民的长远生计得到保障。
农村土地征收；城市房屋拆迁；养殖场关停；企业拆迁；违法建筑；强拆赔偿；商铺拆迁；棚户区改造；城中村改造；旧城改造；修路拆迁；补偿不合理，